หน้าที่รับผิดชอบของสำนักงานคณะกรรมการอาหารและยา คือ การสร้างและส่งเสริมให้ประชาชนได้บริโภคผลิตภัณฑ์สุขภาพที่ปลอดภัยและสมประโยชน์ โดยดูแลให้ผลิตภัณฑ์สุขภาพเหล่านั้นมีคุณภาพตามมาตรฐานและปลอดภัย และมีหน้าที่ส่งเสริมให้เกิดพฤติกรรมการบริโภคที่ถูกต้อง โดยเลือกใช้ข้อมูลวิชาการที่เหมาะสมมีหลักฐานเชื่อถือได้ประกอบการตัดสินใจบริโภคผลิตภัณฑ์สุขภาพ การพัฒนาระบบการส่งเสริมการใช้ยาอย่างสมเหตุผล จึงเป็นภารกิจสำคัญประการหนึ่ง เพื่อให้เกิดความปลอดภัยในการบริโภคผลิตภัณฑ์ยา กองควบคุมยาจึงได้ดำเนินการในรูปแบบของโครงการ 3 โครงการหลักดังนี้

1. โครงการ “การใช้ยาปฏิชีวนะอย่างสมเหตุผล:Antibiotics Smart Use” เพื่อหาต้นแบบ (model) ในการใช้ยาอย่างสมเหตุผล โดยเริ่มจากกลุ่มยาปฏิชีวนะ และจะขยายผลไปยังยากลุ่มอื่นๆต่อไป

2. โครงการลดอิทธิพลการส่งเสริมการขายยาที่ไม่เหมาะสม เพื่อสร้างความเข้าใจและปลุกจิตสำนึกถึงผลกระทบของการส่งเสริมการขายยาอย่างไม่เหมาะสม และส่งเสริมศักยภาพของทุกภาคส่วนที่เกี่ยวข้อง ในการทำให้การส่งเสริมการขายยาอยู่ในขอบเขตที่เหมาะสม

3. โครงการพัฒนาฉลากและเอกสารกำกับยามาตรฐาน เพื่อส่งเสริมให้เกิดมาตรฐานของการแสดงข้อมูลยาในฉลากและเอกสารกำกับยาของประเทศ และเป็นแหล่งข้อมูลสำหรับบุคลากรทางการแพทย์และประชาชน